Poté, co Alexandr VI. přežil invazi Francouzů a zůstal na papežském stolci nedotčen (jen o vlásek), pokračoval v prosazování svých záměrů. Rodina Sforzů mu však stále brání, což ho vede k fyzické válce proti nim. Ani kardinál Giuliano della Rovere se nevzdal snahy zbavit se Alexandra ve Vatikánu. Poté, co se mu nepodařilo papeže legálně sesadit, plánuje kardinál della Rovere jeho zavraždění.