On suit Shinichi, écolier de l'an 2710, visitant à Nara une reconstitution d'une école du XXIe siècle. Il se fait voler son déjeuner par un cerf, et, en partant à sa poursuite, se retrouve mêlé à la fuite d'une étrange jeune fille, elle-même poursuivie par des poursuivants des plus étranges. Ensemble, il feront l'expérience d'un voyage entre passé et futur.