На початку першого сезону спеціального агента ФБР Олівію Данхем викликають розслідувати таємничий спалах, який ледь не вбиває її напарника. Єдиною людиною, яка має відповіді на ці питання, є вчений, що перебуває в ізоляторі, доктор Волтер Бішоп, який може вийти на волю лише під опікою свого сина, що залишився без батьків. Разом вони з'ясовують, що відповідь на цю загадку - лише маленький шматочок набагато більшої, шокуючої правди.